在第二批“不忘初心、牢记使命”主题教育中，中山大学聚焦学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想的鲜明主线和根本任务，推动主题教育与学校中心工作“两结合、两促进”，统筹推进学习教育、调查研究、检视问题和整改落实，抓实抓细各项工作，确保主题教育取得实效。
加强组织领导，统筹部署推进。学校党委成立主题教育领导小组及10个巡回指导组，督促指导各二级单位开展主题教育，一级抓一级，层层抓落实。制定主题教育实施方案、专项整治工作方案，细化学习教育方案、调查研究方案、宣传工作方案、专题民主生活会方案等，召开主题教育工作培训会和全校党支部书记主题教育工作培训研讨会，为各二级单位和巡回指导组开展工作培训，针对基层党支部开展主题教育进行研讨。各级党组织坚持以党的创新理论滋养初心、引领使命，围绕加强学校党的建设和全面落实立德树人根本任务，结合办学治校中的重大问题，用心用力开展主题教育。
深入学习教育，强化政治责任。校党委理论学习中心组开展11次集中学习研讨，围绕全面加强党的建设特别是基层党组织建设、全面落实立德树人根本任务、深入学习贯彻党的十九届四中全会精神等，校领导班子带头学带头讲、认真学认真讲，各二级单位领导班子成员认真开展自学和研讨，结合调查研究和检视问题讲专题党课。基层党支部组织党员开展学习交流等活动，以庆祝新中国成立70周年为契机，开展“我和我的祖国”主题党日活动，深入开展爱国主义教育；依托广州农民运动讲习所、中共三大会址、广东革命博物馆、广东省档案馆主题教育文献展览等红色资源，深入开展革命传统教育；举办“彭华同志先进事迹报告会”，深入开展先进典型教育；组织纪律教育学习月活动，深入开展警示教育。
广泛开展调研，开门听取意见。坚持问题导向，注重开门搞教育，抓调研选题突出“实”，抓重点问题突出“准”，抓一线师生突出“广”，广泛深入开展大调研。校领导班子成员围绕党的建设、教师队伍建设、学生社团工作、党风廉政建设、干部队伍建设、服务国家战略、深化综合改革等重点，确定11个大类22个调研问题，通过座谈交流、实地走访、个别访谈、发放征求意见表、开通征求意见邮箱等方式，开展调研活动130余场次，参与调研人员1400余人，回收征求意见表400余份，形成调研报告21份、问题清单146条。各二级单位领导班子成员结合实际问题，围绕487个主题，确定786个调研问题，开展座谈交流1195场次，完成调研报告425份，检视问题1761个，调研覆盖对象26950人，占全校师生员工总数的34.4%。充分发挥基层党支部作用，把解决师生群众最关心的问题放在突出位置，以党支部为单位开展全体党员为学校建言献策活动，全校915个基层党支部共提出3385条意见建议，学校党委逐条梳理，形成问题清单，分别纳入学校和二级单位整改台账，并及时向党支部和党员师生反馈。
深刻检视问题，抓好即知即改。结合学习教育和调查研究，认真查找自身不足和工作短板，深刻检视存在的问题。开展“党章和党内法规”专题集中学习研讨和对照党章党规找差距专题会议，逐项逐条找差距，从理想信念、宗旨意识、担当精神、纪律作风等方面深挖思想根源，深入开展批评与自我批评。将“改”贯穿始终，真抓真改，即知即改，立行立改。既解决部分师生员工学习、工作、生活密切相关的问题，又解决一些关系学校事业发展的重要问题。如，针对学校辅导员队伍数量不足、结构不合理问题，迅速部署整改落实，选聘一批优秀青年教师担任专职辅导员，增加辅导员数量，优化辅导员队伍专业结构。又如，针对教师科研人员反映的部分科研经费使用难问题，建立完善以信任为前提的科研经费管理机制，适度提高科研活动经费开支标准，明确审批原则及管理流程，制定特殊合理开支“一事一批”解决办法，赋予科研项目负责人间接经费使用及审批权限，切实解决科研经费开支难点堵点问题。再如，针对教职员工反映强烈的专业技术人员职务聘任问题，及时修订完善学校实验工程技术人员等专业技术人员职务聘任办法及实施细则，启动相关工作，得到教职员工普遍好评。
对标对表对责，全面整改落实。对照主题教育标准、推进时间表和职责使命，以“难”为重点，以“实”为目标，以“改”为关键，抓好整改落实各项工作。紧盯深层次难点问题，找准有效“小切口”，拿出真招硬招攻坚克难。如，在基层党建方面，着力提高党支部组织生活质量，做好党员发展和教育管理，发挥党建促立德树人作用。在教师队伍建设方面，抓好教师思想政治工作和师德师风建设，把思政课教师队伍建设作为突破口。在学生社团建设管理方面，强化政治引领和专业指导，突出学术科研类社团作用，发挥学生社团育人功能，实施分类管理。制定整改台账“施工图”，明确整改问题、整改措施、整改责任、整改时限和整改目标，建立整改进度督促机制和整改成效评估机制，重点盯住难题，真改实改、改出实效，确保主题教育整改落实到位。